Merupakan sarana pelayanan kesehatan yang melaksanakan pengukuran, penetapan dan pengujian untuk penentuan jenis penyakit, penyebab penyakit, dan kondisi kesehatan. Jenis pemeriksaan yang dapat dilakukan antara lain hematologi klinik, kimia klinik, imuno klinik, dll. Unit laboratorium RSUD Junjung Besaoh memberikan pelayanan 24 jam.
Saat ini pelayanan yang bisa dilayani di laboratorium RSUD Junjung Besaoh adalah sebagai berikut: